簡要描述:GelRed 和GelGreen 是兩種集高靈敏、低毒性和超穩(wěn)定于一身的的熒光核酸凝膠染色試劑。其水溶染色劑通過美國環(huán)保局安全認(rèn)定,廢棄物可直接倒入下水道,而不會(huì)造成任何環(huán)境污染。(下載美國Litron Laboratories, Inc. 完整安全檢測(cè)報(bào)告)
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部分產(chǎn)品報(bào)價(jià)
Table A. 訂貨信息 | ||||||
Cat# | Product Name | Unit Size | Unit Price | * | 品 牌 | |
41001 | GelRedTM Nucleic Acid Gel Stain, 3X in water | 4.0 L | ¥2,411 | ¥1,200 | Biotium | |
41002 | GelRedTM Nucleic Acid Gel Stain, 10,000X in DMSO | 0.5 mL | ¥1,176 | ¥600 | Biotium | |
41003 | GelRedTM Nucleic Acid Gel Stain, 10,000X in water | 0.5 mL | ¥1,235 | ¥600 | Biotium | |
41003-1 | GelRedTM 10,000X solution in water, bulk pack | 10 mL | ¥19,757 | ¥10,000 | Biotium | |
41004 | GelGreenTM Nucleic Acid Gel Stain, 10,000X in DMSO | 0.5 mL | ¥1,058 | ¥500 | Biotium | |
41005 | GelGreenTM Nucleic Acid Gel Stain, 10,000X in water | 0.5mL | ¥1,176 | ¥600 | Biotium | |
Table B.以下標(biāo)簽可以*地配合以上產(chǎn)品使用: | ||||||
Cat# | Product Name | Unit Size | Unit Price | * | 品 牌 | |
31021 | 1 KB DNA Ladder (100ng/uL) | 30 ug/300 ul | ¥647 |
| Biotium | |
31022 | Ready-to-Use 1 KB DNA Ladder | 150 applications (1.5 ml) | ¥764 | ¥500 | Biotium |
由美國BIOTIUM公司技術(shù)專家研發(fā)的GelRed 和GelGreen 是兩種集高靈敏、低毒性和超穩(wěn)定于一身的的熒光核酸凝膠染色試劑。其水溶染色劑通過美國環(huán)保局安全認(rèn)定,廢棄物可直接倒入下水道,而不會(huì)造成任何環(huán)境污染。(下載美國Litron Laboratories, Inc. 完整安全檢測(cè)報(bào)告)
目前大多數(shù)商業(yè)化的核酸染料(凝膠染色試劑)總是在安全性、穩(wěn)定性和靈敏性等方面不*令人滿意。例如,雖然 EB (溴化乙啶)作為目前使用zui廣泛的核酸凝膠染色試劑,能夠在多數(shù)應(yīng)用中提供可以接受的靈敏度,但它是一種高誘變性的化學(xué)物質(zhì)。而且EB染色后具有較高的背景熒光信號(hào)(如圖1)。 SYBR Green I 和 SYBR Gold 也被廠家宣傳為zui靈敏的凝膠染色試劑。但 SYBR Green I 尤其是 SYBR Gold 在常用的微堿性電泳緩沖溶液或預(yù)制凝膠中會(huì)快速降解,穩(wěn)定性差導(dǎo)致染色效果極不可靠。 SYBR safe 被認(rèn)為是市場(chǎng)上較為安全的核酸染料 ,但它的染色效果還遠(yuǎn)不及 SYBR Green I 。
至于國內(nèi)有公司宣稱的新產(chǎn)品Goldview,我們不想多加評(píng)論。因?yàn)閺臉O為相似的對(duì)比試驗(yàn)結(jié)果來看,該產(chǎn)品似乎就是AO(丫啶橙 ,一種劇毒產(chǎn)品,且熒光亮度不佳)。請(qǐng)看Goldview 與 AO 對(duì)比試驗(yàn)結(jié)果(其中Goldview是從國內(nèi)某公司采購,AO則來自SIGMA,報(bào)告來自開放生物)
高靈敏度
GelRed 和 GelGreen 是目前市場(chǎng)中zui靈敏的凝膠核酸染料
穩(wěn)定性*
可以使用微波爐加熱,可以在室溫下保存
更安全
艾姆斯氏試驗(yàn)結(jié)果表明,該染料的誘變性遠(yuǎn)小于 溴化乙錠 ( EB )
廣泛的適應(yīng)性
適用于預(yù)制凝膠和凝膠電泳后染色
染色過程簡單
與 EB 一樣,在預(yù)制膠和電泳過程中不必?fù)?dān)心染料降解;而電泳后染色過程也只需 30 分鐘且無需脫色或沖洗
對(duì) DNA 和 RNA 的遷移影響極小
對(duì)核酸遷移的影響小于 SYBR Green I
與標(biāo)準(zhǔn)凝膠成像系統(tǒng)以及可見光激發(fā)的凝膠觀察裝置*兼容
使用 312nm 激發(fā)的 UV 凝膠成像系統(tǒng)時(shí), GelRed 可以*的替代 EB ;使用 254nm 激發(fā)的 UV 凝膠成像系統(tǒng)或可見光激發(fā)的凝膠觀察裝置時(shí), GelGreen 足以替代任意一種 SYBR 染料(見圖 4 中的光譜圖)
Biotium公司的GelRed 和 GelGreen 無論用于預(yù)制凝膠染色還是凝膠電泳后染色,都表現(xiàn)出了*的靈敏度。為配合 312 nm UV 凝膠成像系統(tǒng)而設(shè)計(jì)的 GelRed ,在使用了我們新開發(fā)的具有的試驗(yàn)步驟后(該試驗(yàn)步驟中使用稀釋的 NaCl 溶液替代傳統(tǒng)的 TBE 緩沖溶液),在凝膠電泳后染色中優(yōu)于或者至少相當(dāng)于 SYBR Gold 。但與 SYBR Gold 不同, GelRed 在預(yù)制凝膠中使用時(shí)仍然有*的靈敏度,事實(shí)上GelRed 在檢測(cè)低濃度、微量 DNA 方面比 EB 表現(xiàn)出更高的靈敏度,尤其對(duì)小分子量的 DNA 檢測(cè)非常靈敏(圖1)。 GelGreen 可以滿足使用 488 nm 激光凝膠掃描儀或者可見光激發(fā)的 Dark Reader 的研究人員的使用要求。 GelGreen 無論是在預(yù)制凝膠還是凝膠電泳后染色中都與 SYBR Green I 靈敏度相當(dāng),但不存在后者的不穩(wěn)定性問題。實(shí)際上, GelRed 和 GelGreen ,特別是 GelRed 非常穩(wěn)定,可以長期在室溫下保存。當(dāng)這兩種染料稀釋在 TBE 或者類似的電泳緩沖溶液中時(shí)甚至可以使用微波爐加熱,便于采用常規(guī)方法制備預(yù)制凝膠。含有染料的預(yù)制凝膠可以成批制備,長期保存。
同樣重要的是, GelRed 和 GelGreen 相比 EB 或 SYBR Green I 提高了安全性。 獨(dú)立的測(cè)試服務(wù)公司( Litron Laboratories, Inc. )進(jìn)行的標(biāo)準(zhǔn)艾姆斯氏測(cè)試結(jié)果表明, 在 18.5 μ g /mL (該濃度遠(yuǎn)高于推薦用于電泳后染色的 約 4 μ g/mL 的 3X 染色液 )濃度下, GelGreen 沒有誘變性,而 GelRed 也僅在 S9 代謝活化時(shí)有微弱的誘變性。 GelRed 和 GelGreen 的特殊化學(xué)結(jié)構(gòu)使其難以穿透細(xì)胞膜進(jìn)入細(xì)胞,正是這一特性降低了染料的細(xì)胞毒性。如圖3。相反, SYBR Green I 廣泛地用于活細(xì)胞線粒體和核 DNA 染色,這正是由于它能快速的被細(xì)胞吞入。由于已知 SYBR Green I 對(duì)紫外線導(dǎo)致的突變有強(qiáng)烈的增強(qiáng)作用( Ohta et al. Mutat. Res. 492 , 91(2001) ),因此它的高細(xì)胞膜透性使它在紫外環(huán)境觀察時(shí)成為凝膠染色的主要有害物質(zhì)。
GelRed使用方法:
1:膠染法(用法同EB)
1)制膠時(shí)加入GelRed核酸染料(例如:每50mL瓊脂糖溶液中加入5μL GelRed 10,000 × 儲(chǔ)液,以此比例類推)。
2)按照常規(guī)方法進(jìn)行電泳。
注意事項(xiàng):此方法染色染料用量相對(duì)較少。500 μL染料大約可以做100塊50mL的膠。由于GelRed具有良好的熱穩(wěn)定性,可以在熱的瓊脂糖溶液中直接添加,而不需要等待溶液冷卻。搖晃,振蕩或者翻轉(zhuǎn)以保證染料充分混勻。也可以選擇將GelRed儲(chǔ)液加到瓊脂糖粉末和電泳緩沖液中,然后用微波爐或其他常用方式加熱以制備瓊脂糖凝膠。GelRed兼容所有常用的電泳緩沖溶液。含有染料的預(yù)制凝膠溶液可以大量制備,并長期保存直到使用。
此方法不適合預(yù)制聚丙烯酰胺凝膠,對(duì)于聚丙烯酰胺凝膠請(qǐng)使用泡染法。
2.泡染法
1)按照常規(guī)方法進(jìn)行電泳。
2)用H2O將GelRed 10,000× 儲(chǔ)液稀釋約3,300倍到0.1M NaCl中,制成3× 染色液。(例如將15μL GelRed 10,000× 儲(chǔ)液和5mL 1M NaCl加到45mL H2O中)。
3)將凝膠小心地放入合適的容器中,如聚丙烯容器中。緩慢加入足量的3× 染色液浸沒凝膠。室溫振蕩染色30min左右,染色時(shí)間根據(jù)凝膠厚度以及瓊脂糖濃度不同而略有不同。對(duì)于含3.5~10%丙烯酰胺的凝膠,染色時(shí)間通常介于30min到1h,并隨丙烯酰胺含量增加而延長。
注意事項(xiàng):用泡染法染色時(shí),染料用量較多。單次使用的染色液可重復(fù)使用3次左右。3× GelRed染色液可以大量制備,在室溫下避光保存直至用完。
如果總是看到條帶彌散或分離不理想,建議使用泡染法染色以確認(rèn)問題是否與染料有關(guān)。如果染色后問題依舊存在,則說明問題與染料無關(guān),請(qǐng)嘗試:降低瓊脂糖濃度;選用更長的凝膠;延長凝膠時(shí)間以保證邊緣清晰;改進(jìn)上樣技巧或選擇泡染法染色。
特別提醒:如果您使用的是紫外成像儀,請(qǐng)選擇GelRed;如果您使用激光成像儀或希望在可見光下
觀測(cè),請(qǐng)選擇GelGreen在極少數(shù)情況下,質(zhì)粒經(jīng)某些酶切后的DNA樣品會(huì)出現(xiàn)拖尾和分辨率降低,
此時(shí)建議同時(shí)嘗試兩種染色方法以決定哪種方法更加合適。
幾種核酸染料比較 | |||||
名稱 | 靈敏度 | 穩(wěn)定性 | 適用性 | 安全性 | 價(jià)格 |
GelRed | 高 | 高 | 通用大小片段電泳染色 | 美國安全認(rèn)定無毒 | 中 |
GelGreen | 高 | 高 | 通用大小片段電泳染色 | 美國安全認(rèn)定無毒 | 中 |
SYBR Green I | * | 差 | 100bp以上片段電泳染色 | 花菁染料,低毒 | 高 |
SYBR Green II | * | 差 | 單鏈核酸分子電泳染色 | 花菁染料,低毒 | 高 |
Gold View I | 低 | 高 | 500bp以上片段電泳染色 | 高毒性,強(qiáng)致癌 | 低 |
EB | 低 | 高 | 100bp以上片段電泳染色 | 強(qiáng)致癌,強(qiáng)誘變 | 低 |
凡是市場(chǎng)上聲稱具有與Gelred和Gelgreen相同特性的 EB 替代品,且不指明是 Biotium 公司品牌的核酸染料,經(jīng)檢驗(yàn)都是通過Gelred或 Gelgreen稀釋后重新包裝的水貨,染色質(zhì)量遠(yuǎn)不及Biotium原包裝產(chǎn)品。我們鄙視這種損害客戶利益的行為,并堅(jiān)決打擊,發(fā)現(xiàn)一次我們將不再向其供貨! 在此,我們呼吁用戶在購買Biotium公司產(chǎn)品時(shí), 請(qǐng)選擇開放生物--Biotium中國總代理(OPE)或者上海起發(fā)實(shí)驗(yàn)試劑有限公司購買 。
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